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耶鲁开发一种更快,更便宜的方法来分析基因活动

发布时间:2018-05-16

新近发表的一项研究详细介绍了一种称为模块化,早期标记扩增(META)RNA分析的方法,该方法可以跨多个样品同时量化一大批微RNA或mRNA,并且所需的序列深度远小于现有的数字分析技术。 ; / EM>

耶鲁大学的一个研究小组已经开发出一种简单的方法,可以显着减少大规模基因表达探测的时间和成本。研究结果于3月2日在Nature Methods杂志上发表。

由耶鲁医学院放射治疗学助理教授Abhijit Patel博士领导的研究小组创造了一种利用新型高通量DNA测序技术的工具,以便更容易地同时测量大量细胞中的基因活性或组织。虽然DNA被认为是生命的蓝图,但了解哪些基因在不同条件下被激活或去激活,对于我们对生物学和疾病的理解至关重要。

基因表达谱通常用于临床试验。例如,在患有乳腺癌的患者中,通常在肿瘤标本中测量基因表达以预测复发的可能性并确定化疗是否有益。 Patel说,通过额外的验证,这种高通量的方法可用于同时测量许多患者肿瘤的基因表达。最终,该方法可以降低这些测试的成本,使其更加广泛地可用。

“为了对复杂的基因表达模式做出有意义的结论,通常需要对大量临床或实验样本进行统计分析。我们相信这项新技术将有助于此类工作,“该报高级作者Patel说。 “我们很兴奋,因为这种方法使得大规模RNA分析研究更加实用,大多数研究人员和临床实验室都可以使用。”

研究得到了耶鲁癌症中心,蒂娜布鲁兹曼基金会荣誉,鲁道夫安德森奖学金,莱斯利华纳奖学金以及临床和转化科学奖的支持,该奖项授予国家推进转化科学中心的UL1 TR000142和KL2 TR000140,该组织是美国国立卫生研究院。

出版物:Azeet Narayan等人,“通过前期样品平行化的高通量RNA分析”,Nature Methods(2015); DOI:10.1038 / nmeth.3311

资料来源:耶鲁大学Vicky Agnew

图像:Shutterstock的实验室研究